Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALX1Q15699 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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