Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP1Q13835 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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