Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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NCOA4Q13772 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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NCOA4Q13772 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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NCOA4Q13772 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NCOA4Q13772 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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