Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDH18Q13634 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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CDH18Q13634 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CDH18Q13634 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CDH18Q13634 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CDH18Q13634 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDH18Q13634 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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