Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TUBB3Q13509 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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TUBB3Q13509 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TUBB3Q13509 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TUBB3Q13509 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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