Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGDRQ13258 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGDRQ13258 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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