Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NME3Q13232 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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