Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SELENBP1Q13228 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms