Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TRAF3Q13114 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAF3Q13114 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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