Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXI1Q12951 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms