Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EFEMP1Q12805 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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EFEMP1Q12805 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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