Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IFFO1Q0D2I5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms