Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLFN5Q08AF3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLFN5Q08AF3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms