Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF4Q08170 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms