Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms