Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
ERCC6Q03468 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms