Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPARDQ03181 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARDQ03181 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms