Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TNFRSF17Q02223 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFRSF17Q02223 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms