Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XPCQ01831 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XPCQ01831 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XPCQ01831 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XPCQ01831 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms