Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TFAMQ00059 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TFAMQ00059 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms