Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTBP60709 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTBP60709 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTBP60709 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms