Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNQ4P56696 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNQ4P56696 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms