Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGGT1BP53609 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms