Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPT1P50897 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPT1P50897 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPT1P50897 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms