Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLCSP50747 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLCSP50747 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLCSP50747 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms