Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNBP48739 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms