Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms