Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIP4K2AP48426 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms