Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CASP2P42575 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CASP2P42575 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CASP2P42575 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms