Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms