Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDIT3P35638 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDIT3P35638 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms