Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFC4P35249 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFC4P35249 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFC4P35249 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms