Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms