Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMO2P25791 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMO2P25791 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMO2P25791 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMO2P25791 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms