Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4BPBP20851 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms