Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC3P19447 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC3P19447 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms