Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPBP14678 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPBP14678 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms