Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HKR1P10072 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HKR1P10072 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms