Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIMD1P0DJR0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms