Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA1P0DJI8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms