Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms