Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGFRP00533 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EGFRP00533 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EGFRP00533 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGFRP00533 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms