Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG7O95352 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG7O95352 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG7O95352 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG7O95352 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms