Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF40AO75400 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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