Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPLO60437 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPLO60437 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPLO60437 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPLO60437 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPLO60437 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPLO60437 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPLO60437 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPLO60437 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPLO60437 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPLO60437 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPLO60437 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPLO60437 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms