Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD28O15084 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms