Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APAF1O14727 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APAF1O14727 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms