Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLRMTO00411 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms