Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP23O00161 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms