Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBXN8O00124 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms